1947年主人公秦风和白雪本是一对恋人，秦风在共产党组织反对蒋家王朝的学生运动中表现出色，被他的老师—中共地下党的领导人陈天浩吸收入党，并派往敌人的心脏从事地下工作，最终成为一名出色的特工。由于陷蔽工作的特殊性，秦风只能不辞而别……刚怀孕的白雪此时家破人亡，走投无路，无处安身，只好不明就里地接受姑姑—国民党军统的王牌特工的安排，参加了国民党军统的特训班。在生下儿子后，又被派往国外训练，后以进步青年的身份潜入解放区，成为解放军的一名干部，代号“银狐”。

1948年6月的中国，解放战争呈现焦灼状态，中国在两种不同命运、两种不同前途之间摇摆。1948年6月的平西，已经被中国共产党解放，成为东北地区的一个重要兵站。但是由于第二次世界大战的历史沿革，平西名义上还是一个国际共管城市。所以，在这座有着远东色彩的北方都市中，同时存在着中共军事管理委员会、苏军联络处、美军驻华观察站等多方力量。1948年的6月，国共两党的上百万大军都在频繁地调动着。但是，平西还在表面的平静中。随着一纸命令的到达，这种短暂的平静很快被打破了。

该剧是一部反映在抗日战争中以上海沦陷初期为背景的电视连续剧，全剧讴歌了共产党领导全民族一致抗战的英雄壮举。通过描述一群小人物在地下党领导下，沉重打击日本侵略者的一系列惊心动魄、扣人心弦的故事，展现了意志、智慧与胆识的较量，正义与邪恶的较量，一场政治的较量。

1947年，中共苏宁特委联络员桑义州奉调吴兴县委工作，就在他到达的同时，吴兴县委又来了一个桑义州，假桑义州是国民党特务！桑义州无人认识，两个桑则更加真假难辨。县委书记错将假桑当成真的，真桑义州死里逃生。他十分清楚吴兴县委和他本人面对怎样的凶险，他首先想找到上级组织和相识的同志证明自己，但上级机关转移、相识的人也均不知去向。他立即采取第二方案，就是直接铲除那个冒名顶替的敌特。谁知事与愿违，县委和假桑无影无踪，自己却陷入敌人重围……为了保卫党的组织，他义无反顾地投入到险境之中，甚至不惜将自己毁容，誓死追踪并亲

1942年，侵华日军总司令冈村宁次意外得到一个情报：在华岩寺中藏有一件镇寺之宝——《贝叶金经》，其中隐藏了一个惊天秘密，可以让日军轻而易举地实现其占领全中国的狼子野心。为了得到《贝叶金经》，冈村宁次精心策划了代号“阿波罗”的作战行动，派遣由日本浪人组成的日军王牌特工队“樱花小组”秘密潜入重庆，把黑手伸向了华岩寺。得知日军特工潜入重庆的消息后，为了粉碎日寇的阴谋，中共地下党组织、国民党中的爱国人士与华岩寺众僧侣与“樱花小组”展开了殊死搏斗，最后他们用鲜血和生命终于将《贝叶金经》完好无损的保护了下来。

1949年，国民党拟定了一份“秘杀名单”，上面开列了有起义倾向国民党军高级军官，及国统区的爱国民主人士数十人。共产党中央命令潜伏在国民党国防部的地下党员沈剑秋搞到名单，以保护这批人士。国防部保密局上海中心局局长严敬尧、副局长方汝州、保密局女特工叶梦馨、委员长侍从室特工林怡等人为“秘杀行动”和“秘杀名单”各怀心事。叶梦馨从小被沈剑秋的母亲收养，她深爱沈剑秋，而沈剑秋爱的是女军医夏冰。林怡所爱的画家陶公亮是国民党桂系安插在中共上海地下党内部的卧底，而陶公亮的恋人是沈剑秋的小妹沈若兰。这份“名单”藏在国民党保密

1941年，国际局势波谲云诡，中国国内更是暗流涌动，一场暴风雨即将席卷古老的华夏大地。适值此时，国际反法西斯同盟特使访华，与国共双方代表召开秘密会议。汪伪反革命政权闻风而动，却最终扑了个空，无功而返。与此同时，某军统情报站遭到破坏，一番酷刑审讯后得知，汪伪行动的情报系从内部泄露。由此，由着重大的嫌疑的汪伪司令部属员李宁玉（刘威葳 饰）、顾小梦（张歆艺 饰）、金生火（宗平 饰）、吴志国（田雨 饰）、白小年（胡海峰 饰）等5人先后被关入神秘恐怖的裘庄。在之后的88小时内，他们面临的不仅是各种无情的刑讯，更有死

1938年6月，武汉会战爆发，抗战局势危急。军统特工谢庚杨自作主张，将长期秘密关押的中共特工孟庆凡“盗出”监狱并射杀江边，抛尸江中，顺水飘到日军阵地。孟庆凡身上携带着一份谢庚杨伪造的假情报，使日本人相信苏联人将会出兵中国东北，进攻武汉的步伐被迫放缓。由于准备仓促，谢庚杨的计划出错，日本特工佐藤坚信这是中国人的阴谋。他亲自到武汉验证情报真伪。死里逃生的孟庆凡从日本人的拷问中，得知了这份计划会对中共造成伤害。他冒死逃离日军营地，返回武汉进行阻止。“谎言计划”被提交到国共高层面前。为了武汉抗战，国共决定携手完成

珍珠港事件之后，在号称东方小巴黎的哈尔滨，在日本宪兵队特高课的指挥下，哈尔滨谍报站，开始了最后的搜捕，追杀。身为共产党特工的周乙从关内执行秘密任务回来，地下党为了工作方便，安排了一个女报务员顾秋妍为他的假妻子执行任务。随着时间的推移，带着一个月身孕来到周家的顾秋妍渐渐陷入了情感上的痛苦和孤独之中。她希望尽早结束任务，回到自己亲爱的丈夫身边。而周乙的妻子孙悦剑在往山上向抗联运送盘尼西林和消炎药时，被得到情报的特务机关设卡拦截，在漫长的七年中，周乙查出了叛徒，除掉了内奸。但是同时周乙眼睁睁的看着孙悦剑被处死,

三十年代的上海滩，一场家族惨剧使孪生兄弟阿初和阿次在襁褓中骨肉分离。阿初被抱进了上海富商荣家，地位卑微，却因陪读大少爷归国后成为著名医生。阿次加入中共地下党，留学日本后回国成长为一名潜伏在国民党心脏的红色特工。阿初在英国参与了神秘的“雷霆”计划的科学研究，作为二十多年前家族惨案的元凶，潜伏在中国的日本间谍“帝国之花”徐玉真决定不惜代价实施“雷霆”计划并将兄弟两人置于死地，惊天侵略阴谋、刻骨家族仇恨，在揭露真相的过程中兄弟两人由敌对误解、互相猜疑到同仇敌忾、联手抗敌，最终，将日寇多年筹划的阴谋大白于天下，阿