沉没5年的戏鼓船，近期又离奇出现了，传言上有宝贝。馒头随父亲前来寻宝，不料父亲被船员抓走。馒头为救父上船，却发现里面别有洞天。在这里，馒头遇到了形形色色的“戏伶人”，并成为了好友。一次意外中，馒头却被告知，戏鼓船上却只有亡魂。

天地灵气孕育出一颗能量巨大的混元珠，元始天尊将混元珠提炼成灵珠和魔丸，灵珠投胎为人，助周伐纣时可堪大用；而魔丸则会诞出魔王，为祸人间。元始天尊启动了天劫咒语，3年后天雷将会降临，摧毁魔丸。太乙受命将灵珠托生于陈塘关李靖家的儿子哪吒身上。然而阴差阳错，灵珠和魔丸竟然被掉包。本应是灵珠英雄的哪吒却成了混世大魔王。调皮捣蛋顽劣不堪的哪吒却徒有一颗做英雄的心。然而面对众人对魔丸的误解和即将来临的天雷的降临，哪吒是否命中注定会立地成魔？他将何去何从？

一个外号“睡神”的废材少年，因祸得福开启一门功法。从此以后，一个肉体无双的奇才出世。

本季故事发生在王者大陆上塞外边关的长城脚下。为了守卫边关和平，每位登场的角色都远离故土，不远万里来到此地。虽然在这片陌生的土地上，他们都是“异乡人”，但共同的信念让他们有了一个共同的名字——长城守卫军。

《雄兵连》系列是国内首部3D军事科幻题材动漫作品，《雄兵连3雷霆万钧》为该系列故事最新续作，剧情承接上一季，讲述地球与天使阵营结盟，共同对抗外星恶势力的故事。