香港海关在一次例行海上巡逻中，查获一艘藏有大批杀伤力武器的货船，调查过程中遭遇一群海外势力轰炸抢夺。为追查走私真相，张允南（张学友 饰）派出下属周正礼（谢霆锋 饰）与国际刑警一同远赴海外，辗转庞大而复杂的军火黑市，顶着漫天炮火追查线索的周正礼刚有眉目，噩耗却突然从香港传来，原来军火失窃另有隐情……

关超介绍草龟商人菜甫和老板泰哥促成生意合作，从中赚取一些佣金和少量利润，用以偿还欠下的高利贷债款。但钱款仍有很多还未还清，这让关超始终过着拮据的生活。他去找昔日的战友华佬借钱，但被拒绝了。卡比、文尼和文素三个兄弟以摆地摊为生，文素还未成年仍在上学，文尼不想让文素因为摆地摊耽误学业，大哥卡比安慰他们生活比较艰难需要忍耐，答应会找一个工作来维持生计。

恶水之源中的炸弹被郭得友成功拆除，却依然发生爆炸。郭得友反被指认为魔古道余孽性命难保。顾影因是魔古道圣童，血液内含抗体，成了拯救全津城的疫苗母体。肖兰兰之父肖砚因魔古道事件引咎辞职，丁卯扛魔有功虽被炸伤了腿，却被新任天津都督敖旦任命为津城秘书长。丁卯上任第一件事是清理被恶水之源污染的河道。肖兰兰的大表哥范君尧引荐了水利专家西格蒙德，提出“裁弯取直”方案，加速海河排污。因裁弯取直会损害一生门码头航运生意，一生门门主崔疯子强烈反对频频闹事。另一边，郭得友摆脱指认后，追查恶水之源爆炸根源，发现崔疯子打理的一处小

心童从小由父亲天际独自养大，二人表面上是一对模范父女，实际上彼此缺乏沟通。一天，心童遇到了自小吃基因改造食物“超级宝宝”长大的思哲。“超级宝宝”总裁Chole誓要找回思哲，不料被心童和思哲偶然发现了她的阴谋。为了赚钱，Chole明知基因改造食物对儿童有副作用却置之不理。心童将此事告知天际，三人互相扶持决心查出真相。在这个过程中，思哲被心童父女的爱所打动，思哲亦令心童父女打开心扉，反省自身与对方的关系。

中年女子江美香（张艾嘉 饰）自丈夫去世后郁郁寡欢，彻夜难眠，终日困在家整理亡夫遗物。女儿彩虹（蔡思韵 饰）屡劝无效。一天，美香在遗物中发现一条锁匙，因而找到亡夫杨灿镳（任达华 饰）的秘密霓虹灯工场，并从他的青年徒弟李登龙（周汉宁 饰）口中得悉亡夫的遗愿：希望重造一个已拆除的神秘霓虹灯牌。美香在登龙协助下寻找有关灯牌的线索，并向他学习烧制霓虹灯，盼能亲手完成亡夫遗愿。过程中美香回顾和灿镳的美丽邂逅，也从旧客户口中发掘灿镳过去的点滴，似是亡夫留给她的最后慰藉。彩虹眼见母亲因投入霓虹工艺而渐露欢颜，并兴致勃勃想

八年前，从小一起长大的阿齐（黄宗泽 饰）、阿猫（张继聪 饰）和金仔（陈家乐 饰）三兄弟拜入龙头佑哥（黄德斌 饰）门下，佑哥对三人照顾有加。谁料，佑哥势头如日中天时遭刀手伏击，风云人物一朝沦为残废。佑哥出事后，阿齐为了社团忍辱负重；阿猫隐姓埋名，只想和妻子阿悦（卫诗雅 饰）做回普通人；金仔为了上位，不惜暗中助对家公司老板出头。而一心想要为夫报仇的佑嫂胜男（周励淇 饰）查出，佑哥当年出事似与三兄弟其一有关。在情义与利益交织的漩涡中，曾经生死与共的三人将如何抉择各自的命运？他们的决定，又会触发怎样的结局呢？

通缉犯陈桂林（阮经天 饰）在逃亡藏匿中失去最后一个亲人，同时得知自己只有不到三个月的生命。万念俱灰的他原打算投案自首，可是当发现他在三大通缉犯中仅仅排名第三时，内心突然躁动起来。在此之后，他决定仿效古时候周处除三害的故事，临终之际要在江湖上留下他的传奇名号。通过地下医生张贵卿（谢琼煖 饰），陈桂林找到了分别排名第二和第一的香港仔（袁富华 饰）和牛头的线索，随后踏上征途。贪嗔痴，三毒熬煎，红尘混沌之人，被业障缠绕，永远无法跳脱因果轮回……

通缉犯陈桂林生命将尽，却发现自己在通缉榜上只排名第三，他决心查出前两名通缉犯的下落，并将他们一一除掉。陈桂林以为自己已成为当代的周处除三害，却没想到永远参不透的贪嗔痴，才是人生终要面对的罪与罚。n影片引用的“周处除三害”典故，见于《晋书·周处传》和《世说新语》。据记载，少年周处身形魁梧，武力高强，却横行乡里，为邻人所厌。后周处只身斩杀猛虎孽蛟，他自己也浪子回头、改邪归正，至此三害皆除。

谈判专家卓文伟（刘青云 饰）意外成为一桩命案的头号嫌犯，被逼无奈下他占领警署挟持警察作人质，并指定前谈判专家谢家俊（吴镇宇 饰）与自己对话。擅长攻心的谢家俊与技巧高超的卓文伟反复拉锯，唇枪舌战间，两人的立场与心态逐渐发生改变……